史家每诟病《晋书·忠义传》，言其人物事迹多有于晋不忠不义者，原委之一，即在于此。当王敦以诛刁协、刘隗起兵时，王导实际上站在玉敦一边，时人并不以王导为逆，也不以刘隗、刁协为忠。士族权臣可以更易，而“主弱臣强”依旧。

《世说新语·仇隙》，元帝用谯王承刺湘州以扼王敦，为王敦弟王廙所杀，多年以后，承妻泣谓子无忌曰：“王敦昔肆酷汝父，假手世将（廙）。

曆史的結論是，隻有皇權與士族共治天下，平衡和秩序才得以維持。所以，本來隻是兩晉之際具體條件下形成的“王與馬共天下”的暫時局面，就被皇權與士族共同接受，成爲東晉一朝門閥政治的模式。

王敦叛亂兩次舉兵，牽動的矛盾并不全同。王敦一叛，以“清君側”即反對劉隗、刁協爲名，得到士族的普遍支持，這說明士族在東晉的特殊地位和特殊權益，是不容皇權侵犯的。王敦再叛，欲取代司馬氏而獨吞江左，以士族共同反對而告失敗，這說明司馬氏皇權也不容任何一姓士族擅自廢棄。

還需要經過一場政治傾軋和實力較量才行。于是我們看到，有晉元帝重用劉隗、刁協以抑王氏兄弟之舉，由此又引出王敦與執政王導勾結，以南人錢鳳、沈充爲援共叛晉室之舉。

所以，要穩定共天下的政治秩序，要取得皇權與士族的平衡和士族之間的平衡

卻又是明帝所令征讨王敦、王含的大都督、假節。這就是王敦再叛時形勢微妙之所在。王導所統六軍，當即紀瞻“卧護”的宿衛六軍，可知王導還擁有某種勢力可以影響京師形勢。

再則說“導所統六軍，石頭萬五千人，宮内後苑二萬人，護軍（應詹）屯金城六千人。劉遐已至，征北昨已濟江萬五千人。”與王敦、王含通關節的王導

其實由王導而死者，不隻周顗，還有戴淵。後來王敦再叛，以台中軍情告王含者也是王導。上引導遺含書，一則說“得征北（王邃，王導從弟）告，劉遐、陶瞻、蘇峻等深懷憂慮，不謀同辭”；

據《晉書》卷六九《周顗傳》，王敦初叛入京，殺周顗、戴淵，都曾咨之于王導。王導後來說：“吾雖不殺伯仁（周顗），伯仁由我而死，幽冥之中，負此良友！”

《晉書》卷九八《王敦傳》載王導遺王含書，有雲“昔年佞臣亂朝，人懷不甯，如導之流，心思外濟。”這是王導明确承認本與王敦同謀。

王敦再叛，政治形勢非常微妙。原來王敦初叛，是在執政王導的默契下進入建康的，其直接目的是清君側，所謂君側，指明是劉隗、刁協、戴淵等一批王氏家族的仇人。

《晉書》卷二六《食貨志》：“元帝爲晉王（建武元年，317年），課督農功，诏二千石長吏以入谷多少爲殿最。其非宿衛要任，皆宜赴農，使軍各自佃作，即以爲廪。”

除了這幾處強藩以外，東晉軍既寡弱，又無糧廪。

但是祖氏與朝廷亦不相得，用祖約豫州之師以抗王敦，是不可能的。